Pair Indices

Usage

pairwise(N)

Arguments

N
a single numeric value representing the total number of things to undergo pairwise comparison.

Description

A utility function to determine indices for pairwise comparisons.

Value

Returns a two column numeric matrix giving the indices for all pairs.

References

Grant, B.J. et al. (2006) Bioinformatics 22, 2695--2696.

Examples

pairwise(3)
[,1] [,2] [1,] 1 2 [2,] 1 3 [3,] 2 3
pairwise(20)
[,1] [,2] [1,] 1 2 [2,] 1 3 [3,] 1 4 [4,] 1 5 [5,] 1 6 [6,] 1 7 [7,] 1 8 [8,] 1 9 [9,] 1 10 [10,] 1 11 [11,] 1 12 [12,] 1 13 [13,] 1 14 [14,] 1 15 [15,] 1 16 [16,] 1 17 [17,] 1 18 [18,] 1 19 [19,] 1 20 [20,] 2 3 [21,] 2 4 [22,] 2 5 [23,] 2 6 [24,] 2 7 [25,] 2 8 [26,] 2 9 [27,] 2 10 [28,] 2 11 [29,] 2 12 [30,] 2 13 [31,] 2 14 [32,] 2 15 [33,] 2 16 [34,] 2 17 [35,] 2 18 [36,] 2 19 [37,] 2 20 [38,] 3 4 [39,] 3 5 [40,] 3 6 [41,] 3 7 [42,] 3 8 [43,] 3 9 [44,] 3 10 [45,] 3 11 [46,] 3 12 [47,] 3 13 [48,] 3 14 [49,] 3 15 [50,] 3 16 [51,] 3 17 [52,] 3 18 [53,] 3 19 [54,] 3 20 [55,] 4 5 [56,] 4 6 [57,] 4 7 [58,] 4 8 [59,] 4 9 [60,] 4 10 [61,] 4 11 [62,] 4 12 [63,] 4 13 [64,] 4 14 [65,] 4 15 [66,] 4 16 [67,] 4 17 [68,] 4 18 [69,] 4 19 [70,] 4 20 [71,] 5 6 [72,] 5 7 [73,] 5 8 [74,] 5 9 [75,] 5 10 [76,] 5 11 [77,] 5 12 [78,] 5 13 [79,] 5 14 [80,] 5 15 [81,] 5 16 [82,] 5 17 [83,] 5 18 [84,] 5 19 [85,] 5 20 [86,] 6 7 [87,] 6 8 [88,] 6 9 [89,] 6 10 [90,] 6 11 [91,] 6 12 [92,] 6 13 [93,] 6 14 [94,] 6 15 [95,] 6 16 [96,] 6 17 [97,] 6 18 [98,] 6 19 [99,] 6 20 [100,] 7 8 [101,] 7 9 [102,] 7 10 [103,] 7 11 [104,] 7 12 [105,] 7 13 [106,] 7 14 [107,] 7 15 [108,] 7 16 [109,] 7 17 [110,] 7 18 [111,] 7 19 [112,] 7 20 [113,] 8 9 [114,] 8 10 [115,] 8 11 [116,] 8 12 [117,] 8 13 [118,] 8 14 [119,] 8 15 [120,] 8 16 [121,] 8 17 [122,] 8 18 [123,] 8 19 [124,] 8 20 [125,] 9 10 [126,] 9 11 [127,] 9 12 [128,] 9 13 [129,] 9 14 [130,] 9 15 [131,] 9 16 [132,] 9 17 [133,] 9 18 [134,] 9 19 [135,] 9 20 [136,] 10 11 [137,] 10 12 [138,] 10 13 [139,] 10 14 [140,] 10 15 [141,] 10 16 [142,] 10 17 [143,] 10 18 [144,] 10 19 [145,] 10 20 [146,] 11 12 [147,] 11 13 [148,] 11 14 [149,] 11 15 [150,] 11 16 [151,] 11 17 [152,] 11 18 [153,] 11 19 [154,] 11 20 [155,] 12 13 [156,] 12 14 [157,] 12 15 [158,] 12 16 [159,] 12 17 [160,] 12 18 [161,] 12 19 [162,] 12 20 [163,] 13 14 [164,] 13 15 [165,] 13 16 [166,] 13 17 [167,] 13 18 [168,] 13 19 [169,] 13 20 [170,] 14 15 [171,] 14 16 [172,] 14 17 [173,] 14 18 [174,] 14 19 [175,] 14 20 [176,] 15 16 [177,] 15 17 [178,] 15 18 [179,] 15 19 [180,] 15 20 [181,] 16 17 [182,] 16 18 [183,] 16 19 [184,] 16 20 [185,] 17 18 [186,] 17 19 [187,] 17 20 [188,] 18 19 [189,] 18 20 [190,] 19 20

See also

seqidentity

Author

Barry Grant